Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
6030452D12RikQ8CD33 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
6030452D12RikQ8CD33 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
6030452D12RikQ8CD33 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
6030452D12RikQ8CD33 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
6030452D12RikQ8CD33 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
6030452D12RikQ8CD33 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
6030452D12RikQ8CD33 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
6030452D12RikQ8CD33 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
6030452D12RikQ8CD33 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
6030452D12RikQ8CD33 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
6030452D12RikQ8CD33 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
6030452D12RikQ8CD33 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
6030452D12RikQ8CD33 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
6030452D12RikQ8CD33 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
6030452D12RikQ8CD33 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
6030452D12RikQ8CD33 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
6030452D12RikQ8CD33 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
6030452D12RikQ8CD33 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
6030452D12RikQ8CD33 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
6030452D12RikQ8CD33 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
6030452D12RikQ8CD33 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
6030452D12RikQ8CD33 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
6030452D12RikQ8CD33 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
6030452D12RikQ8CD33 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
6030452D12RikQ8CD33 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
6030452D12RikQ8CD33 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
6030452D12RikQ8CD33 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
6030452D12RikQ8CD33 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
6030452D12RikQ8CD33 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
6030452D12RikQ8CD33 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
6030452D12RikQ8CD33 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
6030452D12RikQ8CD33 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
6030452D12RikQ8CD33 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
6030452D12RikQ8CD33 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
6030452D12RikQ8CD33 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
6030452D12RikQ8CD33 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
6030452D12RikQ8CD33 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
6030452D12RikQ8CD33 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.4 ms