Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

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Length 1,013 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Phf20l1Q8CCJ9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Phf20l1Q8CCJ9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Phf20l1Q8CCJ9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Phf20l1Q8CCJ9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Phf20l1Q8CCJ9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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Phf20l1Q8CCJ9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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Phf20l1Q8CCJ9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Phf20l1Q8CCJ9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Phf20l1Q8CCJ9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Phf20l1Q8CCJ9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Phf20l1Q8CCJ9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Phf20l1Q8CCJ9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Phf20l1Q8CCJ9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
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Phf20l1Q8CCJ9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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Phf20l1Q8CCJ9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Phf20l1Q8CCJ9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
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Phf20l1Q8CCJ9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
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Phf20l1Q8CCJ9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Phf20l1Q8CCJ9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
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Phf20l1Q8CCJ9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Phf20l1Q8CCJ9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
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Phf20l1Q8CCJ9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Phf20l1Q8CCJ9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
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Phf20l1Q8CCJ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
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Phf20l1Q8CCJ9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Phf20l1Q8CCJ9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Phf20l1Q8CCJ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Phf20l1Q8CCJ9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Phf20l1Q8CCJ9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Phf20l1Q8CCJ9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Phf20l1Q8CCJ9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Phf20l1Q8CCJ9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Phf20l1Q8CCJ9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
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