Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gpc5Q8CAL5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gpc5Q8CAL5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gpc5Q8CAL5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gpc5Q8CAL5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gpc5Q8CAL5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gpc5Q8CAL5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gpc5Q8CAL5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gpc5Q8CAL5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gpc5Q8CAL5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gpc5Q8CAL5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gpc5Q8CAL5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpc5Q8CAL5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpc5Q8CAL5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gpc5Q8CAL5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gpc5Q8CAL5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gpc5Q8CAL5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gpc5Q8CAL5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gpc5Q8CAL5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gpc5Q8CAL5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gpc5Q8CAL5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gpc5Q8CAL5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gpc5Q8CAL5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Gpc5Q8CAL5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gpc5Q8CAL5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gpc5Q8CAL5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gpc5Q8CAL5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gpc5Q8CAL5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gpc5Q8CAL5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gpc5Q8CAL5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gpc5Q8CAL5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gpc5Q8CAL5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gpc5Q8CAL5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gpc5Q8CAL5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gpc5Q8CAL5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gpc5Q8CAL5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gpc5Q8CAL5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gpc5Q8CAL5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gpc5Q8CAL5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gpc5Q8CAL5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gpc5Q8CAL5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpc5Q8CAL5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpc5Q8CAL5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpc5Q8CAL5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpc5Q8CAL5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpc5Q8CAL5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpc5Q8CAL5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpc5Q8CAL5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gpc5Q8CAL5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gpc5Q8CAL5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gpc5Q8CAL5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gpc5Q8CAL5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gpc5Q8CAL5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gpc5Q8CAL5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gpc5Q8CAL5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gpc5Q8CAL5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gpc5Q8CAL5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gpc5Q8CAL5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gpc5Q8CAL5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gpc5Q8CAL5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gpc5Q8CAL5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Gpc5Q8CAL5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gpc5Q8CAL5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gpc5Q8CAL5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gpc5Q8CAL5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gpc5Q8CAL5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gpc5Q8CAL5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpc5Q8CAL5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpc5Q8CAL5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpc5Q8CAL5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpc5Q8CAL5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpc5Q8CAL5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpc5Q8CAL5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gpc5Q8CAL5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gpc5Q8CAL5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gpc5Q8CAL5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gpc5Q8CAL5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gpc5Q8CAL5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gpc5Q8CAL5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gpc5Q8CAL5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gpc5Q8CAL5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gpc5Q8CAL5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gpc5Q8CAL5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpc5Q8CAL5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpc5Q8CAL5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpc5Q8CAL5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpc5Q8CAL5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpc5Q8CAL5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpc5Q8CAL5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gpc5Q8CAL5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gpc5Q8CAL5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpc5Q8CAL5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpc5Q8CAL5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpc5Q8CAL5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpc5Q8CAL5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpc5Q8CAL5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpc5Q8CAL5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpc5Q8CAL5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpc5Q8CAL5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpc5Q8CAL5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms