Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atg4aQ8C9S8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atg4aQ8C9S8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atg4aQ8C9S8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atg4aQ8C9S8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atg4aQ8C9S8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atg4aQ8C9S8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atg4aQ8C9S8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atg4aQ8C9S8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atg4aQ8C9S8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atg4aQ8C9S8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atg4aQ8C9S8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atg4aQ8C9S8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Atg4aQ8C9S8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atg4aQ8C9S8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Atg4aQ8C9S8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atg4aQ8C9S8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atg4aQ8C9S8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Atg4aQ8C9S8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atg4aQ8C9S8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atg4aQ8C9S8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atg4aQ8C9S8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atg4aQ8C9S8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atg4aQ8C9S8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Atg4aQ8C9S8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atg4aQ8C9S8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atg4aQ8C9S8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Atg4aQ8C9S8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atg4aQ8C9S8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atg4aQ8C9S8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Atg4aQ8C9S8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atg4aQ8C9S8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atg4aQ8C9S8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atg4aQ8C9S8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atg4aQ8C9S8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atg4aQ8C9S8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Atg4aQ8C9S8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atg4aQ8C9S8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atg4aQ8C9S8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atg4aQ8C9S8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atg4aQ8C9S8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atg4aQ8C9S8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atg4aQ8C9S8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atg4aQ8C9S8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atg4aQ8C9S8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atg4aQ8C9S8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atg4aQ8C9S8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atg4aQ8C9S8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Atg4aQ8C9S8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atg4aQ8C9S8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atg4aQ8C9S8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atg4aQ8C9S8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atg4aQ8C9S8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atg4aQ8C9S8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atg4aQ8C9S8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atg4aQ8C9S8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atg4aQ8C9S8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Atg4aQ8C9S8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Atg4aQ8C9S8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atg4aQ8C9S8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atg4aQ8C9S8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atg4aQ8C9S8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atg4aQ8C9S8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atg4aQ8C9S8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atg4aQ8C9S8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atg4aQ8C9S8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atg4aQ8C9S8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atg4aQ8C9S8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atg4aQ8C9S8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atg4aQ8C9S8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg4aQ8C9S8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg4aQ8C9S8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg4aQ8C9S8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atg4aQ8C9S8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atg4aQ8C9S8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atg4aQ8C9S8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Atg4aQ8C9S8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Atg4aQ8C9S8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Atg4aQ8C9S8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Atg4aQ8C9S8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atg4aQ8C9S8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atg4aQ8C9S8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atg4aQ8C9S8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atg4aQ8C9S8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atg4aQ8C9S8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atg4aQ8C9S8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atg4aQ8C9S8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atg4aQ8C9S8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Atg4aQ8C9S8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atg4aQ8C9S8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atg4aQ8C9S8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atg4aQ8C9S8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atg4aQ8C9S8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atg4aQ8C9S8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atg4aQ8C9S8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atg4aQ8C9S8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atg4aQ8C9S8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atg4aQ8C9S8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atg4aQ8C9S8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atg4aQ8C9S8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
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