Protein–RNA interactions for Protein: Q8C850

Scara3, Scavenger receptor class A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara3Q8C850 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scara3Q8C850 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scara3Q8C850 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scara3Q8C850 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Scara3Q8C850 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scara3Q8C850 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scara3Q8C850 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scara3Q8C850 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scara3Q8C850 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scara3Q8C850 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scara3Q8C850 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scara3Q8C850 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scara3Q8C850 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scara3Q8C850 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scara3Q8C850 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scara3Q8C850 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scara3Q8C850 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scara3Q8C850 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scara3Q8C850 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scara3Q8C850 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scara3Q8C850 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scara3Q8C850 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scara3Q8C850 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scara3Q8C850 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scara3Q8C850 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scara3Q8C850 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scara3Q8C850 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scara3Q8C850 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scara3Q8C850 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scara3Q8C850 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scara3Q8C850 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scara3Q8C850 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scara3Q8C850 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scara3Q8C850 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scara3Q8C850 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scara3Q8C850 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scara3Q8C850 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scara3Q8C850 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scara3Q8C850 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scara3Q8C850 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scara3Q8C850 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scara3Q8C850 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scara3Q8C850 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Scara3Q8C850 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Scara3Q8C850 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scara3Q8C850 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scara3Q8C850 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Scara3Q8C850 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scara3Q8C850 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scara3Q8C850 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scara3Q8C850 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scara3Q8C850 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scara3Q8C850 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scara3Q8C850 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scara3Q8C850 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scara3Q8C850 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scara3Q8C850 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scara3Q8C850 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scara3Q8C850 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scara3Q8C850 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scara3Q8C850 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scara3Q8C850 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scara3Q8C850 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scara3Q8C850 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scara3Q8C850 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scara3Q8C850 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scara3Q8C850 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scara3Q8C850 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scara3Q8C850 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scara3Q8C850 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scara3Q8C850 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scara3Q8C850 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scara3Q8C850 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scara3Q8C850 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scara3Q8C850 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scara3Q8C850 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scara3Q8C850 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scara3Q8C850 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scara3Q8C850 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scara3Q8C850 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scara3Q8C850 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Scara3Q8C850 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scara3Q8C850 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scara3Q8C850 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scara3Q8C850 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scara3Q8C850 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scara3Q8C850 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scara3Q8C850 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scara3Q8C850 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scara3Q8C850 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scara3Q8C850 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scara3Q8C850 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scara3Q8C850 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scara3Q8C850 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scara3Q8C850 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scara3Q8C850 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scara3Q8C850 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scara3Q8C850 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scara3Q8C850 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scara3Q8C850 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 336.2 ms