Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y2

Gm9999, Predicted gene 9999, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9999Q8C5Y2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Gm9999Q8C5Y2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm9999Q8C5Y2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm9999Q8C5Y2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm9999Q8C5Y2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm9999Q8C5Y2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm9999Q8C5Y2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm9999Q8C5Y2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm9999Q8C5Y2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm9999Q8C5Y2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm9999Q8C5Y2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm9999Q8C5Y2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm9999Q8C5Y2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm9999Q8C5Y2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm9999Q8C5Y2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm9999Q8C5Y2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm9999Q8C5Y2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm9999Q8C5Y2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm9999Q8C5Y2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm9999Q8C5Y2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm9999Q8C5Y2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm9999Q8C5Y2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Gm9999Q8C5Y2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Gm9999Q8C5Y2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm9999Q8C5Y2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm9999Q8C5Y2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm9999Q8C5Y2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm9999Q8C5Y2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm9999Q8C5Y2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm9999Q8C5Y2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm9999Q8C5Y2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Gm9999Q8C5Y2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm9999Q8C5Y2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm9999Q8C5Y2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm9999Q8C5Y2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm9999Q8C5Y2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm9999Q8C5Y2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Gm9999Q8C5Y2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm9999Q8C5Y2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm9999Q8C5Y2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm9999Q8C5Y2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm9999Q8C5Y2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm9999Q8C5Y2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm9999Q8C5Y2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm9999Q8C5Y2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm9999Q8C5Y2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm9999Q8C5Y2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm9999Q8C5Y2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm9999Q8C5Y2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm9999Q8C5Y2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Gm9999Q8C5Y2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Gm9999Q8C5Y2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Gm9999Q8C5Y2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm9999Q8C5Y2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm9999Q8C5Y2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm9999Q8C5Y2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm9999Q8C5Y2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm9999Q8C5Y2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm9999Q8C5Y2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm9999Q8C5Y2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm9999Q8C5Y2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm9999Q8C5Y2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm9999Q8C5Y2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Gm9999Q8C5Y2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm9999Q8C5Y2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm9999Q8C5Y2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm9999Q8C5Y2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm9999Q8C5Y2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm9999Q8C5Y2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm9999Q8C5Y2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm9999Q8C5Y2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm9999Q8C5Y2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm9999Q8C5Y2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm9999Q8C5Y2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm9999Q8C5Y2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm9999Q8C5Y2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm9999Q8C5Y2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm9999Q8C5Y2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm9999Q8C5Y2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm9999Q8C5Y2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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