Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

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Length 814 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rapgef5Q8C0Q9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rapgef5Q8C0Q9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef5Q8C0Q9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef5Q8C0Q9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef5Q8C0Q9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef5Q8C0Q9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef5Q8C0Q9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef5Q8C0Q9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef5Q8C0Q9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef5Q8C0Q9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef5Q8C0Q9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rapgef5Q8C0Q9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rapgef5Q8C0Q9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rapgef5Q8C0Q9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rapgef5Q8C0Q9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rapgef5Q8C0Q9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rapgef5Q8C0Q9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rapgef5Q8C0Q9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rapgef5Q8C0Q9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef5Q8C0Q9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef5Q8C0Q9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef5Q8C0Q9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef5Q8C0Q9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef5Q8C0Q9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef5Q8C0Q9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rapgef5Q8C0Q9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rapgef5Q8C0Q9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rapgef5Q8C0Q9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rapgef5Q8C0Q9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rapgef5Q8C0Q9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rapgef5Q8C0Q9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rapgef5Q8C0Q9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rapgef5Q8C0Q9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rapgef5Q8C0Q9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rapgef5Q8C0Q9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rapgef5Q8C0Q9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rapgef5Q8C0Q9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rapgef5Q8C0Q9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rapgef5Q8C0Q9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rapgef5Q8C0Q9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rapgef5Q8C0Q9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rapgef5Q8C0Q9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rapgef5Q8C0Q9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rapgef5Q8C0Q9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rapgef5Q8C0Q9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rapgef5Q8C0Q9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rapgef5Q8C0Q9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rapgef5Q8C0Q9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rapgef5Q8C0Q9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rapgef5Q8C0Q9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rapgef5Q8C0Q9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rapgef5Q8C0Q9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rapgef5Q8C0Q9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rapgef5Q8C0Q9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rapgef5Q8C0Q9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rapgef5Q8C0Q9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rapgef5Q8C0Q9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rapgef5Q8C0Q9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rapgef5Q8C0Q9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rapgef5Q8C0Q9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rapgef5Q8C0Q9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rapgef5Q8C0Q9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rapgef5Q8C0Q9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rapgef5Q8C0Q9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rapgef5Q8C0Q9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rapgef5Q8C0Q9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rapgef5Q8C0Q9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rapgef5Q8C0Q9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rapgef5Q8C0Q9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rapgef5Q8C0Q9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rapgef5Q8C0Q9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rapgef5Q8C0Q9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rapgef5Q8C0Q9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rapgef5Q8C0Q9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rapgef5Q8C0Q9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rapgef5Q8C0Q9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rapgef5Q8C0Q9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rapgef5Q8C0Q9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rapgef5Q8C0Q9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rapgef5Q8C0Q9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rapgef5Q8C0Q9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rapgef5Q8C0Q9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rapgef5Q8C0Q9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rapgef5Q8C0Q9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rapgef5Q8C0Q9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rapgef5Q8C0Q9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rapgef5Q8C0Q9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rapgef5Q8C0Q9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rapgef5Q8C0Q9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rapgef5Q8C0Q9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rapgef5Q8C0Q9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef5Q8C0Q9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef5Q8C0Q9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef5Q8C0Q9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rapgef5Q8C0Q9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rapgef5Q8C0Q9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms