Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nek11Q8C0Q4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nek11Q8C0Q4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nek11Q8C0Q4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nek11Q8C0Q4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nek11Q8C0Q4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nek11Q8C0Q4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nek11Q8C0Q4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nek11Q8C0Q4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nek11Q8C0Q4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nek11Q8C0Q4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nek11Q8C0Q4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nek11Q8C0Q4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nek11Q8C0Q4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nek11Q8C0Q4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nek11Q8C0Q4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nek11Q8C0Q4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nek11Q8C0Q4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nek11Q8C0Q4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nek11Q8C0Q4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nek11Q8C0Q4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nek11Q8C0Q4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nek11Q8C0Q4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nek11Q8C0Q4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nek11Q8C0Q4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nek11Q8C0Q4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nek11Q8C0Q4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nek11Q8C0Q4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nek11Q8C0Q4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nek11Q8C0Q4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nek11Q8C0Q4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nek11Q8C0Q4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nek11Q8C0Q4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nek11Q8C0Q4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nek11Q8C0Q4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nek11Q8C0Q4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nek11Q8C0Q4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nek11Q8C0Q4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nek11Q8C0Q4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nek11Q8C0Q4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nek11Q8C0Q4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nek11Q8C0Q4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nek11Q8C0Q4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Nek11Q8C0Q4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Nek11Q8C0Q4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nek11Q8C0Q4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nek11Q8C0Q4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nek11Q8C0Q4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nek11Q8C0Q4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nek11Q8C0Q4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nek11Q8C0Q4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nek11Q8C0Q4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nek11Q8C0Q4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nek11Q8C0Q4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nek11Q8C0Q4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nek11Q8C0Q4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nek11Q8C0Q4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Nek11Q8C0Q4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Nek11Q8C0Q4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nek11Q8C0Q4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nek11Q8C0Q4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nek11Q8C0Q4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nek11Q8C0Q4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nek11Q8C0Q4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nek11Q8C0Q4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nek11Q8C0Q4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nek11Q8C0Q4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nek11Q8C0Q4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nek11Q8C0Q4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nek11Q8C0Q4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nek11Q8C0Q4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nek11Q8C0Q4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nek11Q8C0Q4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nek11Q8C0Q4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nek11Q8C0Q4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nek11Q8C0Q4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nek11Q8C0Q4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nek11Q8C0Q4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nek11Q8C0Q4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nek11Q8C0Q4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Nek11Q8C0Q4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nek11Q8C0Q4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nek11Q8C0Q4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nek11Q8C0Q4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nek11Q8C0Q4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nek11Q8C0Q4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nek11Q8C0Q4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nek11Q8C0Q4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nek11Q8C0Q4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nek11Q8C0Q4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Nek11Q8C0Q4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Nek11Q8C0Q4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nek11Q8C0Q4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Nek11Q8C0Q4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nek11Q8C0Q4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nek11Q8C0Q4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nek11Q8C0Q4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nek11Q8C0Q4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nek11Q8C0Q4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nek11Q8C0Q4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms