Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Iffo1Q8BXL9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Iffo1Q8BXL9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Iffo1Q8BXL9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Iffo1Q8BXL9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Iffo1Q8BXL9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Iffo1Q8BXL9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Iffo1Q8BXL9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Iffo1Q8BXL9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Iffo1Q8BXL9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Iffo1Q8BXL9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Iffo1Q8BXL9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Iffo1Q8BXL9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Iffo1Q8BXL9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Iffo1Q8BXL9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Iffo1Q8BXL9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Iffo1Q8BXL9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Iffo1Q8BXL9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Iffo1Q8BXL9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Iffo1Q8BXL9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Iffo1Q8BXL9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Iffo1Q8BXL9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Iffo1Q8BXL9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Iffo1Q8BXL9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Iffo1Q8BXL9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Iffo1Q8BXL9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Iffo1Q8BXL9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Iffo1Q8BXL9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Iffo1Q8BXL9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Iffo1Q8BXL9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Iffo1Q8BXL9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Iffo1Q8BXL9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Iffo1Q8BXL9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Iffo1Q8BXL9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Iffo1Q8BXL9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Iffo1Q8BXL9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Iffo1Q8BXL9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Iffo1Q8BXL9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Iffo1Q8BXL9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Iffo1Q8BXL9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Iffo1Q8BXL9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Iffo1Q8BXL9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Iffo1Q8BXL9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Iffo1Q8BXL9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Iffo1Q8BXL9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms