Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trerf1Q8BXJ2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trerf1Q8BXJ2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trerf1Q8BXJ2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trerf1Q8BXJ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trerf1Q8BXJ2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trerf1Q8BXJ2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trerf1Q8BXJ2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trerf1Q8BXJ2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trerf1Q8BXJ2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trerf1Q8BXJ2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trerf1Q8BXJ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trerf1Q8BXJ2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trerf1Q8BXJ2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trerf1Q8BXJ2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trerf1Q8BXJ2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trerf1Q8BXJ2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trerf1Q8BXJ2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trerf1Q8BXJ2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trerf1Q8BXJ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trerf1Q8BXJ2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trerf1Q8BXJ2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trerf1Q8BXJ2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trerf1Q8BXJ2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trerf1Q8BXJ2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trerf1Q8BXJ2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trerf1Q8BXJ2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trerf1Q8BXJ2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trerf1Q8BXJ2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trerf1Q8BXJ2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trerf1Q8BXJ2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trerf1Q8BXJ2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trerf1Q8BXJ2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trerf1Q8BXJ2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trerf1Q8BXJ2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trerf1Q8BXJ2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trerf1Q8BXJ2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trerf1Q8BXJ2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trerf1Q8BXJ2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trerf1Q8BXJ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trerf1Q8BXJ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trerf1Q8BXJ2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trerf1Q8BXJ2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trerf1Q8BXJ2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trerf1Q8BXJ2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trerf1Q8BXJ2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trerf1Q8BXJ2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trerf1Q8BXJ2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trerf1Q8BXJ2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trerf1Q8BXJ2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trerf1Q8BXJ2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trerf1Q8BXJ2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trerf1Q8BXJ2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trerf1Q8BXJ2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trerf1Q8BXJ2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trerf1Q8BXJ2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trerf1Q8BXJ2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trerf1Q8BXJ2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trerf1Q8BXJ2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trerf1Q8BXJ2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trerf1Q8BXJ2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trerf1Q8BXJ2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trerf1Q8BXJ2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trerf1Q8BXJ2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trerf1Q8BXJ2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trerf1Q8BXJ2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trerf1Q8BXJ2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trerf1Q8BXJ2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trerf1Q8BXJ2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trerf1Q8BXJ2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trerf1Q8BXJ2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms