Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn17Q8BXA6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn17Q8BXA6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn17Q8BXA6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn17Q8BXA6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn17Q8BXA6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn17Q8BXA6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn17Q8BXA6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn17Q8BXA6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn17Q8BXA6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn17Q8BXA6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn17Q8BXA6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn17Q8BXA6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn17Q8BXA6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn17Q8BXA6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn17Q8BXA6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn17Q8BXA6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn17Q8BXA6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn17Q8BXA6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn17Q8BXA6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn17Q8BXA6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cldn17Q8BXA6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn17Q8BXA6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn17Q8BXA6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn17Q8BXA6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn17Q8BXA6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn17Q8BXA6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn17Q8BXA6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn17Q8BXA6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn17Q8BXA6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn17Q8BXA6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn17Q8BXA6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn17Q8BXA6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn17Q8BXA6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn17Q8BXA6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn17Q8BXA6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn17Q8BXA6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn17Q8BXA6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn17Q8BXA6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn17Q8BXA6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn17Q8BXA6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn17Q8BXA6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn17Q8BXA6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn17Q8BXA6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn17Q8BXA6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn17Q8BXA6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn17Q8BXA6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn17Q8BXA6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn17Q8BXA6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn17Q8BXA6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn17Q8BXA6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn17Q8BXA6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn17Q8BXA6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn17Q8BXA6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn17Q8BXA6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn17Q8BXA6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn17Q8BXA6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn17Q8BXA6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn17Q8BXA6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn17Q8BXA6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn17Q8BXA6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn17Q8BXA6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn17Q8BXA6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn17Q8BXA6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn17Q8BXA6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn17Q8BXA6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn17Q8BXA6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn17Q8BXA6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn17Q8BXA6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn17Q8BXA6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn17Q8BXA6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn17Q8BXA6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn17Q8BXA6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn17Q8BXA6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn17Q8BXA6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn17Q8BXA6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn17Q8BXA6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn17Q8BXA6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn17Q8BXA6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn17Q8BXA6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn17Q8BXA6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn17Q8BXA6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn17Q8BXA6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn17Q8BXA6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn17Q8BXA6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn17Q8BXA6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn17Q8BXA6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn17Q8BXA6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn17Q8BXA6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn17Q8BXA6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn17Q8BXA6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn17Q8BXA6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn17Q8BXA6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn17Q8BXA6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn17Q8BXA6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn17Q8BXA6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn17Q8BXA6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn17Q8BXA6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn17Q8BXA6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn17Q8BXA6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms