Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdcl3Q8BVF2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdcl3Q8BVF2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdcl3Q8BVF2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdcl3Q8BVF2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdcl3Q8BVF2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdcl3Q8BVF2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdcl3Q8BVF2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdcl3Q8BVF2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pdcl3Q8BVF2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pdcl3Q8BVF2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdcl3Q8BVF2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdcl3Q8BVF2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdcl3Q8BVF2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdcl3Q8BVF2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdcl3Q8BVF2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdcl3Q8BVF2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdcl3Q8BVF2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcl3Q8BVF2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcl3Q8BVF2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcl3Q8BVF2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdcl3Q8BVF2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdcl3Q8BVF2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdcl3Q8BVF2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdcl3Q8BVF2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdcl3Q8BVF2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcl3Q8BVF2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcl3Q8BVF2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcl3Q8BVF2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcl3Q8BVF2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcl3Q8BVF2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcl3Q8BVF2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pdcl3Q8BVF2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pdcl3Q8BVF2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pdcl3Q8BVF2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pdcl3Q8BVF2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdcl3Q8BVF2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdcl3Q8BVF2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdcl3Q8BVF2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pdcl3Q8BVF2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pdcl3Q8BVF2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdcl3Q8BVF2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdcl3Q8BVF2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcl3Q8BVF2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdcl3Q8BVF2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdcl3Q8BVF2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdcl3Q8BVF2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdcl3Q8BVF2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdcl3Q8BVF2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdcl3Q8BVF2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pdcl3Q8BVF2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pdcl3Q8BVF2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pdcl3Q8BVF2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pdcl3Q8BVF2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pdcl3Q8BVF2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pdcl3Q8BVF2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdcl3Q8BVF2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdcl3Q8BVF2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdcl3Q8BVF2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdcl3Q8BVF2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdcl3Q8BVF2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdcl3Q8BVF2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdcl3Q8BVF2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdcl3Q8BVF2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdcl3Q8BVF2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdcl3Q8BVF2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdcl3Q8BVF2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdcl3Q8BVF2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdcl3Q8BVF2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdcl3Q8BVF2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdcl3Q8BVF2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdcl3Q8BVF2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pdcl3Q8BVF2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pdcl3Q8BVF2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pdcl3Q8BVF2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pdcl3Q8BVF2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pdcl3Q8BVF2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pdcl3Q8BVF2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdcl3Q8BVF2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdcl3Q8BVF2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdcl3Q8BVF2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdcl3Q8BVF2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdcl3Q8BVF2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdcl3Q8BVF2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdcl3Q8BVF2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdcl3Q8BVF2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdcl3Q8BVF2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdcl3Q8BVF2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdcl3Q8BVF2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdcl3Q8BVF2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdcl3Q8BVF2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdcl3Q8BVF2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdcl3Q8BVF2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pdcl3Q8BVF2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pdcl3Q8BVF2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdcl3Q8BVF2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdcl3Q8BVF2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms