Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU1

Cfap20, Cilia- and flagella-associated protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap20Q8BTU1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap20Q8BTU1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap20Q8BTU1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap20Q8BTU1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cfap20Q8BTU1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap20Q8BTU1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap20Q8BTU1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap20Q8BTU1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap20Q8BTU1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap20Q8BTU1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cfap20Q8BTU1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap20Q8BTU1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap20Q8BTU1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap20Q8BTU1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap20Q8BTU1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfap20Q8BTU1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfap20Q8BTU1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfap20Q8BTU1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap20Q8BTU1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap20Q8BTU1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap20Q8BTU1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap20Q8BTU1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap20Q8BTU1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap20Q8BTU1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cfap20Q8BTU1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cfap20Q8BTU1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfap20Q8BTU1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfap20Q8BTU1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfap20Q8BTU1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfap20Q8BTU1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfap20Q8BTU1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfap20Q8BTU1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfap20Q8BTU1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfap20Q8BTU1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap20Q8BTU1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap20Q8BTU1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap20Q8BTU1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap20Q8BTU1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap20Q8BTU1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cfap20Q8BTU1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfap20Q8BTU1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfap20Q8BTU1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfap20Q8BTU1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfap20Q8BTU1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap20Q8BTU1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap20Q8BTU1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap20Q8BTU1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap20Q8BTU1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap20Q8BTU1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap20Q8BTU1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap20Q8BTU1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap20Q8BTU1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap20Q8BTU1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfap20Q8BTU1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfap20Q8BTU1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap20Q8BTU1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap20Q8BTU1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap20Q8BTU1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap20Q8BTU1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap20Q8BTU1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap20Q8BTU1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap20Q8BTU1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap20Q8BTU1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap20Q8BTU1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap20Q8BTU1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfap20Q8BTU1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfap20Q8BTU1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfap20Q8BTU1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap20Q8BTU1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap20Q8BTU1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap20Q8BTU1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap20Q8BTU1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap20Q8BTU1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap20Q8BTU1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap20Q8BTU1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap20Q8BTU1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap20Q8BTU1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap20Q8BTU1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap20Q8BTU1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfap20Q8BTU1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfap20Q8BTU1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfap20Q8BTU1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfap20Q8BTU1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfap20Q8BTU1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfap20Q8BTU1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfap20Q8BTU1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfap20Q8BTU1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap20Q8BTU1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap20Q8BTU1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap20Q8BTU1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap20Q8BTU1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap20Q8BTU1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap20Q8BTU1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap20Q8BTU1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap20Q8BTU1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap20Q8BTU1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap20Q8BTU1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap20Q8BTU1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap20Q8BTU1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap20Q8BTU1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms