Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTR5

Dusp28, Dual specificity phosphatase 28, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp28Q8BTR5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms