Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLD6

Ankrd55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd55Q8BLD6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd55Q8BLD6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd55Q8BLD6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd55Q8BLD6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd55Q8BLD6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd55Q8BLD6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd55Q8BLD6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd55Q8BLD6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd55Q8BLD6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd55Q8BLD6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd55Q8BLD6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd55Q8BLD6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd55Q8BLD6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd55Q8BLD6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd55Q8BLD6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd55Q8BLD6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd55Q8BLD6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd55Q8BLD6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd55Q8BLD6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd55Q8BLD6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd55Q8BLD6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd55Q8BLD6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd55Q8BLD6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd55Q8BLD6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd55Q8BLD6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd55Q8BLD6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd55Q8BLD6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd55Q8BLD6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd55Q8BLD6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd55Q8BLD6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd55Q8BLD6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd55Q8BLD6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd55Q8BLD6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd55Q8BLD6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd55Q8BLD6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd55Q8BLD6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd55Q8BLD6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd55Q8BLD6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd55Q8BLD6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd55Q8BLD6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd55Q8BLD6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ankrd55Q8BLD6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ankrd55Q8BLD6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ankrd55Q8BLD6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd55Q8BLD6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd55Q8BLD6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd55Q8BLD6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd55Q8BLD6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd55Q8BLD6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd55Q8BLD6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd55Q8BLD6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd55Q8BLD6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd55Q8BLD6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd55Q8BLD6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd55Q8BLD6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd55Q8BLD6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd55Q8BLD6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd55Q8BLD6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd55Q8BLD6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd55Q8BLD6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd55Q8BLD6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd55Q8BLD6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd55Q8BLD6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd55Q8BLD6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd55Q8BLD6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ankrd55Q8BLD6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ankrd55Q8BLD6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ankrd55Q8BLD6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ankrd55Q8BLD6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ankrd55Q8BLD6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms