Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf187Q8BFX1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf187Q8BFX1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf187Q8BFX1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf187Q8BFX1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf187Q8BFX1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf187Q8BFX1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf187Q8BFX1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf187Q8BFX1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf187Q8BFX1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf187Q8BFX1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf187Q8BFX1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf187Q8BFX1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf187Q8BFX1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf187Q8BFX1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf187Q8BFX1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf187Q8BFX1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf187Q8BFX1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf187Q8BFX1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf187Q8BFX1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf187Q8BFX1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf187Q8BFX1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf187Q8BFX1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf187Q8BFX1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf187Q8BFX1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf187Q8BFX1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf187Q8BFX1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf187Q8BFX1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf187Q8BFX1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf187Q8BFX1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf187Q8BFX1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf187Q8BFX1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf187Q8BFX1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf187Q8BFX1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf187Q8BFX1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf187Q8BFX1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf187Q8BFX1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf187Q8BFX1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf187Q8BFX1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rnf187Q8BFX1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rnf187Q8BFX1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rnf187Q8BFX1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf187Q8BFX1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf187Q8BFX1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf187Q8BFX1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf187Q8BFX1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf187Q8BFX1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf187Q8BFX1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf187Q8BFX1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf187Q8BFX1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf187Q8BFX1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf187Q8BFX1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf187Q8BFX1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf187Q8BFX1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf187Q8BFX1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf187Q8BFX1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf187Q8BFX1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf187Q8BFX1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf187Q8BFX1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf187Q8BFX1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rnf187Q8BFX1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf187Q8BFX1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf187Q8BFX1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf187Q8BFX1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf187Q8BFX1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf187Q8BFX1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf187Q8BFX1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf187Q8BFX1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf187Q8BFX1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf187Q8BFX1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf187Q8BFX1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf187Q8BFX1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf187Q8BFX1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf187Q8BFX1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf187Q8BFX1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf187Q8BFX1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf187Q8BFX1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf187Q8BFX1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf187Q8BFX1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf187Q8BFX1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf187Q8BFX1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf187Q8BFX1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf187Q8BFX1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf187Q8BFX1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf187Q8BFX1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf187Q8BFX1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf187Q8BFX1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf187Q8BFX1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf187Q8BFX1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf187Q8BFX1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf187Q8BFX1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf187Q8BFX1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf187Q8BFX1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf187Q8BFX1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf187Q8BFX1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf187Q8BFX1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf187Q8BFX1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf187Q8BFX1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf187Q8BFX1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf187Q8BFX1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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