Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Liat1Q810M6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Liat1Q810M6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Liat1Q810M6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Liat1Q810M6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Liat1Q810M6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Liat1Q810M6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Liat1Q810M6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Liat1Q810M6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Liat1Q810M6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Liat1Q810M6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Liat1Q810M6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Liat1Q810M6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Liat1Q810M6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Liat1Q810M6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Liat1Q810M6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Liat1Q810M6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Liat1Q810M6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Liat1Q810M6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Liat1Q810M6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Liat1Q810M6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Liat1Q810M6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Liat1Q810M6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Liat1Q810M6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Liat1Q810M6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Liat1Q810M6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Liat1Q810M6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Liat1Q810M6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Liat1Q810M6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Liat1Q810M6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Liat1Q810M6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Liat1Q810M6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Liat1Q810M6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Liat1Q810M6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Liat1Q810M6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Liat1Q810M6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Liat1Q810M6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Liat1Q810M6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Liat1Q810M6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Liat1Q810M6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Liat1Q810M6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Liat1Q810M6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Liat1Q810M6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Liat1Q810M6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Liat1Q810M6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Liat1Q810M6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Liat1Q810M6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Liat1Q810M6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Liat1Q810M6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Liat1Q810M6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Liat1Q810M6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Liat1Q810M6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Liat1Q810M6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Liat1Q810M6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Liat1Q810M6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Liat1Q810M6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Liat1Q810M6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Liat1Q810M6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Liat1Q810M6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Liat1Q810M6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Liat1Q810M6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Liat1Q810M6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Liat1Q810M6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Liat1Q810M6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Liat1Q810M6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Liat1Q810M6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Liat1Q810M6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Liat1Q810M6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Liat1Q810M6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Liat1Q810M6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Liat1Q810M6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Liat1Q810M6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Liat1Q810M6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Liat1Q810M6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Liat1Q810M6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Liat1Q810M6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Liat1Q810M6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms