Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnupnQ80W37 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnupnQ80W37 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnupnQ80W37 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnupnQ80W37 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SnupnQ80W37 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnupnQ80W37 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnupnQ80W37 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnupnQ80W37 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnupnQ80W37 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SnupnQ80W37 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnupnQ80W37 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnupnQ80W37 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnupnQ80W37 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnupnQ80W37 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnupnQ80W37 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SnupnQ80W37 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SnupnQ80W37 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SnupnQ80W37 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SnupnQ80W37 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SnupnQ80W37 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SnupnQ80W37 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SnupnQ80W37 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnupnQ80W37 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SnupnQ80W37 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnupnQ80W37 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnupnQ80W37 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SnupnQ80W37 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SnupnQ80W37 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnupnQ80W37 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnupnQ80W37 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnupnQ80W37 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SnupnQ80W37 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnupnQ80W37 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnupnQ80W37 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnupnQ80W37 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SnupnQ80W37 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SnupnQ80W37 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SnupnQ80W37 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SnupnQ80W37 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SnupnQ80W37 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SnupnQ80W37 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SnupnQ80W37 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SnupnQ80W37 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SnupnQ80W37 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SnupnQ80W37 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SnupnQ80W37 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SnupnQ80W37 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SnupnQ80W37 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SnupnQ80W37 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SnupnQ80W37 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SnupnQ80W37 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SnupnQ80W37 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SnupnQ80W37 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SnupnQ80W37 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SnupnQ80W37 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SnupnQ80W37 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SnupnQ80W37 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SnupnQ80W37 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SnupnQ80W37 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SnupnQ80W37 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SnupnQ80W37 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SnupnQ80W37 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SnupnQ80W37 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnupnQ80W37 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnupnQ80W37 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnupnQ80W37 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnupnQ80W37 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms