Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pnma8aQ80VM8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pnma8aQ80VM8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pnma8aQ80VM8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pnma8aQ80VM8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pnma8aQ80VM8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pnma8aQ80VM8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pnma8aQ80VM8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pnma8aQ80VM8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pnma8aQ80VM8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pnma8aQ80VM8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pnma8aQ80VM8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pnma8aQ80VM8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pnma8aQ80VM8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms