Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pnma8aQ80VM8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pnma8aQ80VM8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pnma8aQ80VM8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pnma8aQ80VM8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pnma8aQ80VM8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pnma8aQ80VM8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pnma8aQ80VM8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pnma8aQ80VM8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pnma8aQ80VM8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pnma8aQ80VM8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pnma8aQ80VM8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pnma8aQ80VM8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pnma8aQ80VM8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pnma8aQ80VM8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnma8aQ80VM8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pnma8aQ80VM8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pnma8aQ80VM8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pnma8aQ80VM8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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