Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF4

Sdccag8, Serologically defined colon cancer antigen 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag8Q80UF4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sdccag8Q80UF4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sdccag8Q80UF4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sdccag8Q80UF4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sdccag8Q80UF4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sdccag8Q80UF4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sdccag8Q80UF4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sdccag8Q80UF4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sdccag8Q80UF4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sdccag8Q80UF4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Sdccag8Q80UF4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sdccag8Q80UF4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sdccag8Q80UF4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sdccag8Q80UF4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sdccag8Q80UF4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sdccag8Q80UF4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sdccag8Q80UF4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sdccag8Q80UF4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sdccag8Q80UF4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sdccag8Q80UF4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sdccag8Q80UF4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sdccag8Q80UF4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sdccag8Q80UF4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sdccag8Q80UF4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sdccag8Q80UF4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sdccag8Q80UF4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sdccag8Q80UF4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sdccag8Q80UF4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sdccag8Q80UF4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sdccag8Q80UF4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sdccag8Q80UF4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sdccag8Q80UF4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sdccag8Q80UF4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sdccag8Q80UF4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Sdccag8Q80UF4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sdccag8Q80UF4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Sdccag8Q80UF4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sdccag8Q80UF4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sdccag8Q80UF4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sdccag8Q80UF4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sdccag8Q80UF4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sdccag8Q80UF4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sdccag8Q80UF4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sdccag8Q80UF4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sdccag8Q80UF4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sdccag8Q80UF4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sdccag8Q80UF4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sdccag8Q80UF4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sdccag8Q80UF4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sdccag8Q80UF4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sdccag8Q80UF4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sdccag8Q80UF4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sdccag8Q80UF4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sdccag8Q80UF4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Sdccag8Q80UF4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sdccag8Q80UF4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sdccag8Q80UF4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sdccag8Q80UF4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Sdccag8Q80UF4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sdccag8Q80UF4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sdccag8Q80UF4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sdccag8Q80UF4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sdccag8Q80UF4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sdccag8Q80UF4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sdccag8Q80UF4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sdccag8Q80UF4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sdccag8Q80UF4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sdccag8Q80UF4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sdccag8Q80UF4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sdccag8Q80UF4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sdccag8Q80UF4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sdccag8Q80UF4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sdccag8Q80UF4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sdccag8Q80UF4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sdccag8Q80UF4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sdccag8Q80UF4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sdccag8Q80UF4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sdccag8Q80UF4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sdccag8Q80UF4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Sdccag8Q80UF4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sdccag8Q80UF4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sdccag8Q80UF4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sdccag8Q80UF4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sdccag8Q80UF4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sdccag8Q80UF4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sdccag8Q80UF4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sdccag8Q80UF4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sdccag8Q80UF4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sdccag8Q80UF4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sdccag8Q80UF4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sdccag8Q80UF4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sdccag8Q80UF4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sdccag8Q80UF4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sdccag8Q80UF4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sdccag8Q80UF4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sdccag8Q80UF4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sdccag8Q80UF4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sdccag8Q80UF4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sdccag8Q80UF4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sdccag8Q80UF4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms