Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SnphQ80U23 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SnphQ80U23 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SnphQ80U23 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SnphQ80U23 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SnphQ80U23 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SnphQ80U23 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SnphQ80U23 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SnphQ80U23 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SnphQ80U23 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SnphQ80U23 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SnphQ80U23 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SnphQ80U23 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnphQ80U23 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms