Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Pja2Q80U04 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pja2Q80U04 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pja2Q80U04 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pja2Q80U04 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pja2Q80U04 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pja2Q80U04 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pja2Q80U04 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pja2Q80U04 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pja2Q80U04 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pja2Q80U04 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pja2Q80U04 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pja2Q80U04 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pja2Q80U04 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pja2Q80U04 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pja2Q80U04 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pja2Q80U04 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pja2Q80U04 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pja2Q80U04 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pja2Q80U04 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pja2Q80U04 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pja2Q80U04 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pja2Q80U04 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pja2Q80U04 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pja2Q80U04 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pja2Q80U04 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pja2Q80U04 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pja2Q80U04 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pja2Q80U04 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pja2Q80U04 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pja2Q80U04 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pja2Q80U04 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pja2Q80U04 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pja2Q80U04 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pja2Q80U04 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pja2Q80U04 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pja2Q80U04 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pja2Q80U04 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pja2Q80U04 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pja2Q80U04 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pja2Q80U04 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pja2Q80U04 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pja2Q80U04 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pja2Q80U04 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pja2Q80U04 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pja2Q80U04 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pja2Q80U04 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pja2Q80U04 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms