Protein–RNA interactions for Protein: Q78TU8

Fam107a, Family with sequence similarity 107, member A, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107aQ78TU8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam107aQ78TU8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam107aQ78TU8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam107aQ78TU8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam107aQ78TU8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam107aQ78TU8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam107aQ78TU8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam107aQ78TU8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam107aQ78TU8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam107aQ78TU8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam107aQ78TU8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam107aQ78TU8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam107aQ78TU8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam107aQ78TU8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam107aQ78TU8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam107aQ78TU8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam107aQ78TU8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam107aQ78TU8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam107aQ78TU8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam107aQ78TU8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam107aQ78TU8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam107aQ78TU8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam107aQ78TU8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam107aQ78TU8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam107aQ78TU8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam107aQ78TU8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam107aQ78TU8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam107aQ78TU8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam107aQ78TU8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam107aQ78TU8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam107aQ78TU8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam107aQ78TU8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam107aQ78TU8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam107aQ78TU8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam107aQ78TU8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam107aQ78TU8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam107aQ78TU8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam107aQ78TU8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam107aQ78TU8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam107aQ78TU8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam107aQ78TU8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam107aQ78TU8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam107aQ78TU8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam107aQ78TU8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam107aQ78TU8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam107aQ78TU8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms