Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmed3Q78IS1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmed3Q78IS1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmed3Q78IS1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmed3Q78IS1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmed3Q78IS1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmed3Q78IS1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmed3Q78IS1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmed3Q78IS1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmed3Q78IS1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmed3Q78IS1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmed3Q78IS1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmed3Q78IS1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmed3Q78IS1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmed3Q78IS1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmed3Q78IS1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmed3Q78IS1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmed3Q78IS1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmed3Q78IS1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmed3Q78IS1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmed3Q78IS1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmed3Q78IS1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmed3Q78IS1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmed3Q78IS1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmed3Q78IS1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmed3Q78IS1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmed3Q78IS1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmed3Q78IS1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmed3Q78IS1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmed3Q78IS1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmed3Q78IS1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmed3Q78IS1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmed3Q78IS1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmed3Q78IS1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmed3Q78IS1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tmed3Q78IS1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tmed3Q78IS1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmed3Q78IS1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmed3Q78IS1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmed3Q78IS1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmed3Q78IS1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmed3Q78IS1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmed3Q78IS1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmed3Q78IS1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmed3Q78IS1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmed3Q78IS1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmed3Q78IS1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmed3Q78IS1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmed3Q78IS1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmed3Q78IS1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmed3Q78IS1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmed3Q78IS1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmed3Q78IS1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmed3Q78IS1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmed3Q78IS1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmed3Q78IS1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmed3Q78IS1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmed3Q78IS1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms