Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube2r2Q6ZWZ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube2r2Q6ZWZ2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube2r2Q6ZWZ2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube2r2Q6ZWZ2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube2r2Q6ZWZ2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube2r2Q6ZWZ2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2r2Q6ZWZ2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube2r2Q6ZWZ2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2r2Q6ZWZ2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2r2Q6ZWZ2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2r2Q6ZWZ2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ube2r2Q6ZWZ2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube2r2Q6ZWZ2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2r2Q6ZWZ2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms