Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR4

Ppp2r2b, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r2bQ6ZWR4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp2r2bQ6ZWR4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp2r2bQ6ZWR4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp2r2bQ6ZWR4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp2r2bQ6ZWR4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp2r2bQ6ZWR4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppp2r2bQ6ZWR4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppp2r2bQ6ZWR4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp2r2bQ6ZWR4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppp2r2bQ6ZWR4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp2r2bQ6ZWR4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp2r2bQ6ZWR4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp2r2bQ6ZWR4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp2r2bQ6ZWR4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp2r2bQ6ZWR4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp2r2bQ6ZWR4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp2r2bQ6ZWR4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp2r2bQ6ZWR4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp2r2bQ6ZWR4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp2r2bQ6ZWR4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp2r2bQ6ZWR4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms