Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Syne2Q6ZWQ0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Syne2Q6ZWQ0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms