Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
March6Q6ZQ89 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
March6Q6ZQ89 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
March6Q6ZQ89 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
March6Q6ZQ89 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
March6Q6ZQ89 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
March6Q6ZQ89 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
March6Q6ZQ89 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
March6Q6ZQ89 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
March6Q6ZQ89 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
March6Q6ZQ89 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
March6Q6ZQ89 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
March6Q6ZQ89 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
March6Q6ZQ89 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
March6Q6ZQ89 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
March6Q6ZQ89 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
March6Q6ZQ89 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
March6Q6ZQ89 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
March6Q6ZQ89 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
March6Q6ZQ89 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
March6Q6ZQ89 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
March6Q6ZQ89 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
March6Q6ZQ89 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
March6Q6ZQ89 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
March6Q6ZQ89 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
March6Q6ZQ89 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
March6Q6ZQ89 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
March6Q6ZQ89 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
March6Q6ZQ89 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
March6Q6ZQ89 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
March6Q6ZQ89 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
March6Q6ZQ89 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms