Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot1Q6ZQ08 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot1Q6ZQ08 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot1Q6ZQ08 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot1Q6ZQ08 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot1Q6ZQ08 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot1Q6ZQ08 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot1Q6ZQ08 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot1Q6ZQ08 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnot1Q6ZQ08 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnot1Q6ZQ08 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnot1Q6ZQ08 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnot1Q6ZQ08 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnot1Q6ZQ08 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnot1Q6ZQ08 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnot1Q6ZQ08 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnot1Q6ZQ08 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot1Q6ZQ08 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot1Q6ZQ08 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot1Q6ZQ08 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot1Q6ZQ08 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot1Q6ZQ08 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cnot1Q6ZQ08 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cnot1Q6ZQ08 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnot1Q6ZQ08 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot1Q6ZQ08 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot1Q6ZQ08 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnot1Q6ZQ08 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot1Q6ZQ08 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot1Q6ZQ08 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot1Q6ZQ08 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot1Q6ZQ08 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnot1Q6ZQ08 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnot1Q6ZQ08 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cnot1Q6ZQ08 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot1Q6ZQ08 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot1Q6ZQ08 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot1Q6ZQ08 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot1Q6ZQ08 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot1Q6ZQ08 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot1Q6ZQ08 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot1Q6ZQ08 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cnot1Q6ZQ08 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot1Q6ZQ08 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot1Q6ZQ08 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot1Q6ZQ08 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot1Q6ZQ08 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot1Q6ZQ08 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot1Q6ZQ08 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot1Q6ZQ08 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot1Q6ZQ08 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot1Q6ZQ08 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot1Q6ZQ08 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot1Q6ZQ08 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot1Q6ZQ08 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot1Q6ZQ08 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot1Q6ZQ08 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot1Q6ZQ08 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot1Q6ZQ08 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot1Q6ZQ08 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot1Q6ZQ08 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot1Q6ZQ08 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot1Q6ZQ08 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot1Q6ZQ08 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot1Q6ZQ08 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot1Q6ZQ08 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot1Q6ZQ08 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot1Q6ZQ08 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot1Q6ZQ08 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot1Q6ZQ08 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot1Q6ZQ08 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot1Q6ZQ08 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot1Q6ZQ08 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot1Q6ZQ08 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot1Q6ZQ08 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot1Q6ZQ08 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot1Q6ZQ08 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot1Q6ZQ08 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot1Q6ZQ08 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot1Q6ZQ08 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot1Q6ZQ08 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.6 ms