Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Ino80Q6ZPV2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ino80Q6ZPV2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ino80Q6ZPV2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Ino80Q6ZPV2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Ino80Q6ZPV2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ino80Q6ZPV2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ino80Q6ZPV2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ino80Q6ZPV2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ino80Q6ZPV2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Ino80Q6ZPV2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ino80Q6ZPV2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ino80Q6ZPV2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ino80Q6ZPV2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ino80Q6ZPV2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ino80Q6ZPV2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Ino80Q6ZPV2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Ino80Q6ZPV2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Ino80Q6ZPV2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ino80Q6ZPV2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ino80Q6ZPV2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ino80Q6ZPV2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Ino80Q6ZPV2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Ino80Q6ZPV2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ino80Q6ZPV2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Ino80Q6ZPV2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ino80Q6ZPV2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ino80Q6ZPV2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ino80Q6ZPV2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ino80Q6ZPV2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ino80Q6ZPV2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ino80Q6ZPV2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ino80Q6ZPV2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ino80Q6ZPV2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Ino80Q6ZPV2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Ino80Q6ZPV2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ino80Q6ZPV2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ino80Q6ZPV2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ino80Q6ZPV2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ino80Q6ZPV2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Ino80Q6ZPV2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ino80Q6ZPV2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ino80Q6ZPV2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ino80Q6ZPV2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ino80Q6ZPV2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ino80Q6ZPV2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ino80Q6ZPV2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ino80Q6ZPV2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ino80Q6ZPV2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ino80Q6ZPV2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ino80Q6ZPV2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ino80Q6ZPV2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Ino80Q6ZPV2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ino80Q6ZPV2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ino80Q6ZPV2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Ino80Q6ZPV2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ino80Q6ZPV2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ino80Q6ZPV2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Ino80Q6ZPV2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ino80Q6ZPV2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Ino80Q6ZPV2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ino80Q6ZPV2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ino80Q6ZPV2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ino80Q6ZPV2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ino80Q6ZPV2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Ino80Q6ZPV2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ino80Q6ZPV2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ino80Q6ZPV2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ino80Q6ZPV2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ino80Q6ZPV2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Ino80Q6ZPV2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ino80Q6ZPV2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ino80Q6ZPV2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ino80Q6ZPV2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ino80Q6ZPV2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ino80Q6ZPV2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ino80Q6ZPV2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ino80Q6ZPV2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ino80Q6ZPV2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Ino80Q6ZPV2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ino80Q6ZPV2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ino80Q6ZPV2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ino80Q6ZPV2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ino80Q6ZPV2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Ino80Q6ZPV2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Ino80Q6ZPV2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Ino80Q6ZPV2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ino80Q6ZPV2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ino80Q6ZPV2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ino80Q6ZPV2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ino80Q6ZPV2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ino80Q6ZPV2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ino80Q6ZPV2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Ino80Q6ZPV2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ino80Q6ZPV2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ino80Q6ZPV2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ino80Q6ZPV2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ino80Q6ZPV2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Ino80Q6ZPV2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Ino80Q6ZPV2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms