Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY53

AY358078, HN1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY358078Q6UY53 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AY358078Q6UY53 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AY358078Q6UY53 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AY358078Q6UY53 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AY358078Q6UY53 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AY358078Q6UY53 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AY358078Q6UY53 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AY358078Q6UY53 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AY358078Q6UY53 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AY358078Q6UY53 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AY358078Q6UY53 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AY358078Q6UY53 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AY358078Q6UY53 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AY358078Q6UY53 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AY358078Q6UY53 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AY358078Q6UY53 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AY358078Q6UY53 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AY358078Q6UY53 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AY358078Q6UY53 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AY358078Q6UY53 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AY358078Q6UY53 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AY358078Q6UY53 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AY358078Q6UY53 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AY358078Q6UY53 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AY358078Q6UY53 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AY358078Q6UY53 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AY358078Q6UY53 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AY358078Q6UY53 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AY358078Q6UY53 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AY358078Q6UY53 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AY358078Q6UY53 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AY358078Q6UY53 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AY358078Q6UY53 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AY358078Q6UY53 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AY358078Q6UY53 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AY358078Q6UY53 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AY358078Q6UY53 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AY358078Q6UY53 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AY358078Q6UY53 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AY358078Q6UY53 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AY358078Q6UY53 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AY358078Q6UY53 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AY358078Q6UY53 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AY358078Q6UY53 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AY358078Q6UY53 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AY358078Q6UY53 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AY358078Q6UY53 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AY358078Q6UY53 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AY358078Q6UY53 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AY358078Q6UY53 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AY358078Q6UY53 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AY358078Q6UY53 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AY358078Q6UY53 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AY358078Q6UY53 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AY358078Q6UY53 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AY358078Q6UY53 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AY358078Q6UY53 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AY358078Q6UY53 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AY358078Q6UY53 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AY358078Q6UY53 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AY358078Q6UY53 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AY358078Q6UY53 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AY358078Q6UY53 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AY358078Q6UY53 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AY358078Q6UY53 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AY358078Q6UY53 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AY358078Q6UY53 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AY358078Q6UY53 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AY358078Q6UY53 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AY358078Q6UY53 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AY358078Q6UY53 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AY358078Q6UY53 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AY358078Q6UY53 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AY358078Q6UY53 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AY358078Q6UY53 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AY358078Q6UY53 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AY358078Q6UY53 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AY358078Q6UY53 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AY358078Q6UY53 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AY358078Q6UY53 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AY358078Q6UY53 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AY358078Q6UY53 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AY358078Q6UY53 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AY358078Q6UY53 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AY358078Q6UY53 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AY358078Q6UY53 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AY358078Q6UY53 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AY358078Q6UY53 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AY358078Q6UY53 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AY358078Q6UY53 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AY358078Q6UY53 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AY358078Q6UY53 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AY358078Q6UY53 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AY358078Q6UY53 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AY358078Q6UY53 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AY358078Q6UY53 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AY358078Q6UY53 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AY358078Q6UY53 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AY358078Q6UY53 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AY358078Q6UY53 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms