Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc9c1Q6UJY2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc9c1Q6UJY2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc9c1Q6UJY2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc9c1Q6UJY2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc9c1Q6UJY2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc9c1Q6UJY2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc9c1Q6UJY2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc9c1Q6UJY2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc9c1Q6UJY2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc9c1Q6UJY2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc9c1Q6UJY2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc9c1Q6UJY2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc9c1Q6UJY2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc9c1Q6UJY2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc9c1Q6UJY2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc9c1Q6UJY2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc9c1Q6UJY2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc9c1Q6UJY2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc9c1Q6UJY2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slc9c1Q6UJY2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc9c1Q6UJY2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slc9c1Q6UJY2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc9c1Q6UJY2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc9c1Q6UJY2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc9c1Q6UJY2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc9c1Q6UJY2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc9c1Q6UJY2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc9c1Q6UJY2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc9c1Q6UJY2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc9c1Q6UJY2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc9c1Q6UJY2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc9c1Q6UJY2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc9c1Q6UJY2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Slc9c1Q6UJY2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slc9c1Q6UJY2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Slc9c1Q6UJY2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Slc9c1Q6UJY2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slc9c1Q6UJY2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Slc9c1Q6UJY2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Slc9c1Q6UJY2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Slc9c1Q6UJY2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Slc9c1Q6UJY2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slc9c1Q6UJY2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slc9c1Q6UJY2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slc9c1Q6UJY2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slc9c1Q6UJY2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slc9c1Q6UJY2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Slc9c1Q6UJY2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slc9c1Q6UJY2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Slc9c1Q6UJY2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slc9c1Q6UJY2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slc9c1Q6UJY2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slc9c1Q6UJY2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slc9c1Q6UJY2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc9c1Q6UJY2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc9c1Q6UJY2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc9c1Q6UJY2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc9c1Q6UJY2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc9c1Q6UJY2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc9c1Q6UJY2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc9c1Q6UJY2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc9c1Q6UJY2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc9c1Q6UJY2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slc9c1Q6UJY2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slc9c1Q6UJY2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc9c1Q6UJY2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc9c1Q6UJY2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc9c1Q6UJY2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slc9c1Q6UJY2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slc9c1Q6UJY2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slc9c1Q6UJY2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slc9c1Q6UJY2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc9c1Q6UJY2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc9c1Q6UJY2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc9c1Q6UJY2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc9c1Q6UJY2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc9c1Q6UJY2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Slc9c1Q6UJY2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Slc9c1Q6UJY2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slc9c1Q6UJY2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slc9c1Q6UJY2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Slc9c1Q6UJY2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Slc9c1Q6UJY2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Slc9c1Q6UJY2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc9c1Q6UJY2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc9c1Q6UJY2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc9c1Q6UJY2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc9c1Q6UJY2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc9c1Q6UJY2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc9c1Q6UJY2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc9c1Q6UJY2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc9c1Q6UJY2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc9c1Q6UJY2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc9c1Q6UJY2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc9c1Q6UJY2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc9c1Q6UJY2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slc9c1Q6UJY2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slc9c1Q6UJY2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slc9c1Q6UJY2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms