Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd300ld3Q6SJQ5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd300ld3Q6SJQ5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300ld3Q6SJQ5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd300ld3Q6SJQ5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd300ld3Q6SJQ5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cd300ld3Q6SJQ5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd300ld3Q6SJQ5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd300ld3Q6SJQ5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300ld3Q6SJQ5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd300ld3Q6SJQ5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd300ld3Q6SJQ5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd300ld3Q6SJQ5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd300ld3Q6SJQ5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd300ld3Q6SJQ5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd300ld3Q6SJQ5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd300ld3Q6SJQ5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms