Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGG2

Gmip, GEM-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmipQ6PGG2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GmipQ6PGG2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GmipQ6PGG2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GmipQ6PGG2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GmipQ6PGG2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GmipQ6PGG2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GmipQ6PGG2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GmipQ6PGG2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GmipQ6PGG2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GmipQ6PGG2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GmipQ6PGG2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GmipQ6PGG2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GmipQ6PGG2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GmipQ6PGG2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GmipQ6PGG2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GmipQ6PGG2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GmipQ6PGG2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GmipQ6PGG2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GmipQ6PGG2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GmipQ6PGG2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GmipQ6PGG2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GmipQ6PGG2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GmipQ6PGG2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GmipQ6PGG2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GmipQ6PGG2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GmipQ6PGG2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GmipQ6PGG2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GmipQ6PGG2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GmipQ6PGG2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GmipQ6PGG2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GmipQ6PGG2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GmipQ6PGG2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GmipQ6PGG2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GmipQ6PGG2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GmipQ6PGG2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GmipQ6PGG2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GmipQ6PGG2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GmipQ6PGG2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GmipQ6PGG2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GmipQ6PGG2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GmipQ6PGG2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GmipQ6PGG2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GmipQ6PGG2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GmipQ6PGG2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GmipQ6PGG2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GmipQ6PGG2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GmipQ6PGG2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GmipQ6PGG2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GmipQ6PGG2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GmipQ6PGG2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GmipQ6PGG2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GmipQ6PGG2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GmipQ6PGG2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GmipQ6PGG2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms