Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf4Q6PFF0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scaf4Q6PFF0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scaf4Q6PFF0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf4Q6PFF0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf4Q6PFF0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf4Q6PFF0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf4Q6PFF0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf4Q6PFF0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf4Q6PFF0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf4Q6PFF0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf4Q6PFF0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf4Q6PFF0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf4Q6PFF0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf4Q6PFF0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf4Q6PFF0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf4Q6PFF0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf4Q6PFF0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf4Q6PFF0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf4Q6PFF0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf4Q6PFF0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf4Q6PFF0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf4Q6PFF0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf4Q6PFF0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf4Q6PFF0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scaf4Q6PFF0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scaf4Q6PFF0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf4Q6PFF0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf4Q6PFF0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scaf4Q6PFF0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf4Q6PFF0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf4Q6PFF0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scaf4Q6PFF0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf4Q6PFF0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf4Q6PFF0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf4Q6PFF0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf4Q6PFF0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf4Q6PFF0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scaf4Q6PFF0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scaf4Q6PFF0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf4Q6PFF0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf4Q6PFF0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf4Q6PFF0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Scaf4Q6PFF0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Scaf4Q6PFF0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf4Q6PFF0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf4Q6PFF0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf4Q6PFF0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf4Q6PFF0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf4Q6PFF0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf4Q6PFF0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf4Q6PFF0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf4Q6PFF0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms