Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf1cQ6PDZ2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf1cQ6PDZ2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Taf1cQ6PDZ2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Taf1cQ6PDZ2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Taf1cQ6PDZ2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Taf1cQ6PDZ2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Taf1cQ6PDZ2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Taf1cQ6PDZ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Taf1cQ6PDZ2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf1cQ6PDZ2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf1cQ6PDZ2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf1cQ6PDZ2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Taf1cQ6PDZ2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Taf1cQ6PDZ2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Taf1cQ6PDZ2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Taf1cQ6PDZ2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Taf1cQ6PDZ2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf1cQ6PDZ2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf1cQ6PDZ2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf1cQ6PDZ2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Taf1cQ6PDZ2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Taf1cQ6PDZ2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Taf1cQ6PDZ2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Taf1cQ6PDZ2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf1cQ6PDZ2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf1cQ6PDZ2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Taf1cQ6PDZ2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Taf1cQ6PDZ2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Taf1cQ6PDZ2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf1cQ6PDZ2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf1cQ6PDZ2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf1cQ6PDZ2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf1cQ6PDZ2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf1cQ6PDZ2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf1cQ6PDZ2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf1cQ6PDZ2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf1cQ6PDZ2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf1cQ6PDZ2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf1cQ6PDZ2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf1cQ6PDZ2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf1cQ6PDZ2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf1cQ6PDZ2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf1cQ6PDZ2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf1cQ6PDZ2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf1cQ6PDZ2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Taf1cQ6PDZ2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Taf1cQ6PDZ2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Taf1cQ6PDZ2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Taf1cQ6PDZ2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Taf1cQ6PDZ2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Taf1cQ6PDZ2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Taf1cQ6PDZ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Taf1cQ6PDZ2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Taf1cQ6PDZ2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Taf1cQ6PDZ2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Taf1cQ6PDZ2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Taf1cQ6PDZ2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Taf1cQ6PDZ2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Taf1cQ6PDZ2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf1cQ6PDZ2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf1cQ6PDZ2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf1cQ6PDZ2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf1cQ6PDZ2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Taf1cQ6PDZ2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Taf1cQ6PDZ2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Taf1cQ6PDZ2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Taf1cQ6PDZ2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Taf1cQ6PDZ2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Taf1cQ6PDZ2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Taf1cQ6PDZ2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Taf1cQ6PDZ2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Taf1cQ6PDZ2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Taf1cQ6PDZ2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf1cQ6PDZ2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf1cQ6PDZ2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf1cQ6PDZ2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf1cQ6PDZ2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf1cQ6PDZ2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf1cQ6PDZ2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf1cQ6PDZ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf1cQ6PDZ2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf1cQ6PDZ2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf1cQ6PDZ2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf1cQ6PDZ2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf1cQ6PDZ2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf1cQ6PDZ2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf1cQ6PDZ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf1cQ6PDZ2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf1cQ6PDZ2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf1cQ6PDZ2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf1cQ6PDZ2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf1cQ6PDZ2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf1cQ6PDZ2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf1cQ6PDZ2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf1cQ6PDZ2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf1cQ6PDZ2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf1cQ6PDZ2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf1cQ6PDZ2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms