Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rundc3bQ6PDC0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc3bQ6PDC0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc3bQ6PDC0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rundc3bQ6PDC0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rundc3bQ6PDC0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rundc3bQ6PDC0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rundc3bQ6PDC0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rundc3bQ6PDC0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rundc3bQ6PDC0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rundc3bQ6PDC0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rundc3bQ6PDC0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rundc3bQ6PDC0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rundc3bQ6PDC0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rundc3bQ6PDC0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rundc3bQ6PDC0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rundc3bQ6PDC0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rundc3bQ6PDC0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rundc3bQ6PDC0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rundc3bQ6PDC0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rundc3bQ6PDC0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rundc3bQ6PDC0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rundc3bQ6PDC0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rundc3bQ6PDC0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rundc3bQ6PDC0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rundc3bQ6PDC0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rundc3bQ6PDC0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rundc3bQ6PDC0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rundc3bQ6PDC0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rundc3bQ6PDC0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rundc3bQ6PDC0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rundc3bQ6PDC0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rundc3bQ6PDC0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rundc3bQ6PDC0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rundc3bQ6PDC0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rundc3bQ6PDC0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rundc3bQ6PDC0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rundc3bQ6PDC0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rundc3bQ6PDC0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rundc3bQ6PDC0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rundc3bQ6PDC0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rundc3bQ6PDC0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rundc3bQ6PDC0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rundc3bQ6PDC0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rundc3bQ6PDC0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc3bQ6PDC0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms