Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Gapvd1Q6PAR5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Gapvd1Q6PAR5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Gapvd1Q6PAR5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Gapvd1Q6PAR5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC38■■■■□ 3.67
Gapvd1Q6PAR5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Gapvd1Q6PAR5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Gapvd1Q6PAR5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Gapvd1Q6PAR5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Gapvd1Q6PAR5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Gapvd1Q6PAR5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Gapvd1Q6PAR5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Gapvd1Q6PAR5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Gapvd1Q6PAR5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Gapvd1Q6PAR5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Gapvd1Q6PAR5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Gapvd1Q6PAR5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Gapvd1Q6PAR5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Gapvd1Q6PAR5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Gapvd1Q6PAR5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Gapvd1Q6PAR5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Gapvd1Q6PAR5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Gapvd1Q6PAR5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Gapvd1Q6PAR5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Gapvd1Q6PAR5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Gapvd1Q6PAR5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Gapvd1Q6PAR5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Gapvd1Q6PAR5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Gapvd1Q6PAR5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Gapvd1Q6PAR5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Gapvd1Q6PAR5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Gapvd1Q6PAR5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Gapvd1Q6PAR5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Gapvd1Q6PAR5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Gapvd1Q6PAR5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Gapvd1Q6PAR5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Gapvd1Q6PAR5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Gapvd1Q6PAR5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
Gapvd1Q6PAR5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Gapvd1Q6PAR5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Gapvd1Q6PAR5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Gapvd1Q6PAR5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Gapvd1Q6PAR5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Gapvd1Q6PAR5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Gapvd1Q6PAR5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Gapvd1Q6PAR5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Gapvd1Q6PAR5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Gapvd1Q6PAR5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Gapvd1Q6PAR5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Gapvd1Q6PAR5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Gapvd1Q6PAR5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Gapvd1Q6PAR5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Gapvd1Q6PAR5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Gapvd1Q6PAR5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Gapvd1Q6PAR5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Gapvd1Q6PAR5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Gapvd1Q6PAR5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Gapvd1Q6PAR5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Gapvd1Q6PAR5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Gapvd1Q6PAR5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Gapvd1Q6PAR5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Gapvd1Q6PAR5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Gapvd1Q6PAR5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Gapvd1Q6PAR5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Gapvd1Q6PAR5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Gapvd1Q6PAR5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Gapvd1Q6PAR5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Gapvd1Q6PAR5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Gapvd1Q6PAR5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Gapvd1Q6PAR5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Gapvd1Q6PAR5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Gapvd1Q6PAR5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Gapvd1Q6PAR5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Gapvd1Q6PAR5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Gapvd1Q6PAR5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Gapvd1Q6PAR5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Gapvd1Q6PAR5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Gapvd1Q6PAR5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Gapvd1Q6PAR5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Gapvd1Q6PAR5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Gapvd1Q6PAR5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Gapvd1Q6PAR5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Gapvd1Q6PAR5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Gapvd1Q6PAR5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Gapvd1Q6PAR5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Gapvd1Q6PAR5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Gapvd1Q6PAR5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Gapvd1Q6PAR5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
Gapvd1Q6PAR5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Gapvd1Q6PAR5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Gapvd1Q6PAR5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Gapvd1Q6PAR5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Gapvd1Q6PAR5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Gapvd1Q6PAR5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Gapvd1Q6PAR5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Gapvd1Q6PAR5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Gapvd1Q6PAR5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Gapvd1Q6PAR5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Gapvd1Q6PAR5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Gapvd1Q6PAR5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms