Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx6Q6P8X1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx6Q6P8X1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx6Q6P8X1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx6Q6P8X1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx6Q6P8X1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx6Q6P8X1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx6Q6P8X1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx6Q6P8X1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx6Q6P8X1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx6Q6P8X1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx6Q6P8X1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx6Q6P8X1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx6Q6P8X1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx6Q6P8X1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx6Q6P8X1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx6Q6P8X1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx6Q6P8X1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx6Q6P8X1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx6Q6P8X1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx6Q6P8X1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx6Q6P8X1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx6Q6P8X1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx6Q6P8X1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx6Q6P8X1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx6Q6P8X1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx6Q6P8X1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx6Q6P8X1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx6Q6P8X1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx6Q6P8X1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx6Q6P8X1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx6Q6P8X1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx6Q6P8X1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx6Q6P8X1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx6Q6P8X1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx6Q6P8X1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx6Q6P8X1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx6Q6P8X1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx6Q6P8X1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms