Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6P7

Parp6, Poly [ADP-ribose] polymerase 6, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp6Q6P6P7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Parp6Q6P6P7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Parp6Q6P6P7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Parp6Q6P6P7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Parp6Q6P6P7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Parp6Q6P6P7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Parp6Q6P6P7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Parp6Q6P6P7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Parp6Q6P6P7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Parp6Q6P6P7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Parp6Q6P6P7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Parp6Q6P6P7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Parp6Q6P6P7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Parp6Q6P6P7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Parp6Q6P6P7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Parp6Q6P6P7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Parp6Q6P6P7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Parp6Q6P6P7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Parp6Q6P6P7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Parp6Q6P6P7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Parp6Q6P6P7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Parp6Q6P6P7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Parp6Q6P6P7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Parp6Q6P6P7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Parp6Q6P6P7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Parp6Q6P6P7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Parp6Q6P6P7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Parp6Q6P6P7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Parp6Q6P6P7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Parp6Q6P6P7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Parp6Q6P6P7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Parp6Q6P6P7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Parp6Q6P6P7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Parp6Q6P6P7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Parp6Q6P6P7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Parp6Q6P6P7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Parp6Q6P6P7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Parp6Q6P6P7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Parp6Q6P6P7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Parp6Q6P6P7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Parp6Q6P6P7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Parp6Q6P6P7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Parp6Q6P6P7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Parp6Q6P6P7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Parp6Q6P6P7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Parp6Q6P6P7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Parp6Q6P6P7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Parp6Q6P6P7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Parp6Q6P6P7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Parp6Q6P6P7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Parp6Q6P6P7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Parp6Q6P6P7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Parp6Q6P6P7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Parp6Q6P6P7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Parp6Q6P6P7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Parp6Q6P6P7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Parp6Q6P6P7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Parp6Q6P6P7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Parp6Q6P6P7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Parp6Q6P6P7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Parp6Q6P6P7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Parp6Q6P6P7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Parp6Q6P6P7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Parp6Q6P6P7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Parp6Q6P6P7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Parp6Q6P6P7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Parp6Q6P6P7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Parp6Q6P6P7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Parp6Q6P6P7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Parp6Q6P6P7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Parp6Q6P6P7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Parp6Q6P6P7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Parp6Q6P6P7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Parp6Q6P6P7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Parp6Q6P6P7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Parp6Q6P6P7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 925.2 ms