Protein–RNA interactions for Protein: Q6P566

Lix1, Protein limb expression 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lix1Q6P566 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lix1Q6P566 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lix1Q6P566 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lix1Q6P566 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lix1Q6P566 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lix1Q6P566 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lix1Q6P566 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lix1Q6P566 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lix1Q6P566 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lix1Q6P566 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lix1Q6P566 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lix1Q6P566 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lix1Q6P566 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lix1Q6P566 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lix1Q6P566 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lix1Q6P566 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lix1Q6P566 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lix1Q6P566 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lix1Q6P566 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lix1Q6P566 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lix1Q6P566 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lix1Q6P566 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lix1Q6P566 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lix1Q6P566 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lix1Q6P566 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lix1Q6P566 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lix1Q6P566 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lix1Q6P566 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lix1Q6P566 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lix1Q6P566 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lix1Q6P566 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lix1Q6P566 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lix1Q6P566 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lix1Q6P566 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lix1Q6P566 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lix1Q6P566 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lix1Q6P566 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lix1Q6P566 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lix1Q6P566 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lix1Q6P566 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lix1Q6P566 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lix1Q6P566 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lix1Q6P566 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lix1Q6P566 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lix1Q6P566 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lix1Q6P566 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lix1Q6P566 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lix1Q6P566 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lix1Q6P566 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lix1Q6P566 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lix1Q6P566 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lix1Q6P566 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lix1Q6P566 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lix1Q6P566 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lix1Q6P566 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lix1Q6P566 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lix1Q6P566 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lix1Q6P566 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lix1Q6P566 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lix1Q6P566 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lix1Q6P566 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lix1Q6P566 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lix1Q6P566 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lix1Q6P566 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lix1Q6P566 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lix1Q6P566 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lix1Q6P566 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lix1Q6P566 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lix1Q6P566 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lix1Q6P566 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lix1Q6P566 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lix1Q6P566 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lix1Q6P566 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lix1Q6P566 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lix1Q6P566 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms