Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NipblQ6KCD5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NipblQ6KCD5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NipblQ6KCD5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NipblQ6KCD5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NipblQ6KCD5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NipblQ6KCD5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NipblQ6KCD5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NipblQ6KCD5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NipblQ6KCD5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NipblQ6KCD5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NipblQ6KCD5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NipblQ6KCD5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NipblQ6KCD5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NipblQ6KCD5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NipblQ6KCD5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NipblQ6KCD5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NipblQ6KCD5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NipblQ6KCD5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NipblQ6KCD5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NipblQ6KCD5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NipblQ6KCD5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NipblQ6KCD5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NipblQ6KCD5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NipblQ6KCD5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NipblQ6KCD5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NipblQ6KCD5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NipblQ6KCD5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NipblQ6KCD5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NipblQ6KCD5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NipblQ6KCD5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NipblQ6KCD5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NipblQ6KCD5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NipblQ6KCD5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NipblQ6KCD5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NipblQ6KCD5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NipblQ6KCD5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NipblQ6KCD5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NipblQ6KCD5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NipblQ6KCD5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NipblQ6KCD5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NipblQ6KCD5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NipblQ6KCD5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NipblQ6KCD5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NipblQ6KCD5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NipblQ6KCD5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NipblQ6KCD5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NipblQ6KCD5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NipblQ6KCD5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NipblQ6KCD5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NipblQ6KCD5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NipblQ6KCD5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NipblQ6KCD5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NipblQ6KCD5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NipblQ6KCD5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NipblQ6KCD5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NipblQ6KCD5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NipblQ6KCD5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NipblQ6KCD5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NipblQ6KCD5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NipblQ6KCD5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NipblQ6KCD5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NipblQ6KCD5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NipblQ6KCD5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NipblQ6KCD5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NipblQ6KCD5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NipblQ6KCD5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NipblQ6KCD5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NipblQ6KCD5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NipblQ6KCD5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NipblQ6KCD5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NipblQ6KCD5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NipblQ6KCD5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NipblQ6KCD5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NipblQ6KCD5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NipblQ6KCD5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NipblQ6KCD5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NipblQ6KCD5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NipblQ6KCD5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NipblQ6KCD5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NipblQ6KCD5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NipblQ6KCD5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NipblQ6KCD5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NipblQ6KCD5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms