Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg16l2Q6KAU8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg16l2Q6KAU8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg16l2Q6KAU8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg16l2Q6KAU8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg16l2Q6KAU8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg16l2Q6KAU8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg16l2Q6KAU8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg16l2Q6KAU8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg16l2Q6KAU8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg16l2Q6KAU8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg16l2Q6KAU8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg16l2Q6KAU8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg16l2Q6KAU8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg16l2Q6KAU8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg16l2Q6KAU8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atg16l2Q6KAU8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg16l2Q6KAU8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg16l2Q6KAU8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg16l2Q6KAU8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg16l2Q6KAU8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg16l2Q6KAU8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg16l2Q6KAU8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg16l2Q6KAU8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg16l2Q6KAU8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg16l2Q6KAU8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg16l2Q6KAU8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg16l2Q6KAU8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg16l2Q6KAU8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg16l2Q6KAU8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg16l2Q6KAU8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg16l2Q6KAU8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg16l2Q6KAU8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg16l2Q6KAU8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg16l2Q6KAU8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg16l2Q6KAU8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg16l2Q6KAU8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg16l2Q6KAU8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg16l2Q6KAU8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg16l2Q6KAU8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg16l2Q6KAU8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg16l2Q6KAU8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg16l2Q6KAU8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg16l2Q6KAU8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg16l2Q6KAU8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg16l2Q6KAU8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg16l2Q6KAU8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg16l2Q6KAU8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg16l2Q6KAU8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg16l2Q6KAU8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg16l2Q6KAU8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg16l2Q6KAU8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg16l2Q6KAU8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg16l2Q6KAU8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg16l2Q6KAU8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg16l2Q6KAU8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg16l2Q6KAU8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg16l2Q6KAU8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg16l2Q6KAU8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg16l2Q6KAU8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg16l2Q6KAU8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg16l2Q6KAU8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg16l2Q6KAU8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg16l2Q6KAU8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg16l2Q6KAU8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg16l2Q6KAU8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atg16l2Q6KAU8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg16l2Q6KAU8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg16l2Q6KAU8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg16l2Q6KAU8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg16l2Q6KAU8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg16l2Q6KAU8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg16l2Q6KAU8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg16l2Q6KAU8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg16l2Q6KAU8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg16l2Q6KAU8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg16l2Q6KAU8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg16l2Q6KAU8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg16l2Q6KAU8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg16l2Q6KAU8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg16l2Q6KAU8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg16l2Q6KAU8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg16l2Q6KAU8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg16l2Q6KAU8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg16l2Q6KAU8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg16l2Q6KAU8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg16l2Q6KAU8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg16l2Q6KAU8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg16l2Q6KAU8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg16l2Q6KAU8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg16l2Q6KAU8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg16l2Q6KAU8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg16l2Q6KAU8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg16l2Q6KAU8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg16l2Q6KAU8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg16l2Q6KAU8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg16l2Q6KAU8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg16l2Q6KAU8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg16l2Q6KAU8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms