Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Hecw2Q6I6G8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Hecw2Q6I6G8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Hecw2Q6I6G8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Hecw2Q6I6G8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Hecw2Q6I6G8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Hecw2Q6I6G8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Hecw2Q6I6G8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Hecw2Q6I6G8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Hecw2Q6I6G8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Hecw2Q6I6G8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Hecw2Q6I6G8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Hecw2Q6I6G8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Hecw2Q6I6G8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Hecw2Q6I6G8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Hecw2Q6I6G8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Hecw2Q6I6G8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Hecw2Q6I6G8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Hecw2Q6I6G8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Hecw2Q6I6G8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Hecw2Q6I6G8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Hecw2Q6I6G8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Hecw2Q6I6G8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Hecw2Q6I6G8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Hecw2Q6I6G8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Hecw2Q6I6G8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Hecw2Q6I6G8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Hecw2Q6I6G8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Hecw2Q6I6G8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Hecw2Q6I6G8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Hecw2Q6I6G8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Hecw2Q6I6G8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Hecw2Q6I6G8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Hecw2Q6I6G8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Hecw2Q6I6G8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Hecw2Q6I6G8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Hecw2Q6I6G8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Hecw2Q6I6G8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Hecw2Q6I6G8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Hecw2Q6I6G8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Hecw2Q6I6G8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Hecw2Q6I6G8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Hecw2Q6I6G8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Hecw2Q6I6G8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Hecw2Q6I6G8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Hecw2Q6I6G8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Hecw2Q6I6G8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Hecw2Q6I6G8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Hecw2Q6I6G8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Hecw2Q6I6G8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Hecw2Q6I6G8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Hecw2Q6I6G8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Hecw2Q6I6G8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Hecw2Q6I6G8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Hecw2Q6I6G8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Hecw2Q6I6G8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Hecw2Q6I6G8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Hecw2Q6I6G8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Hecw2Q6I6G8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Hecw2Q6I6G8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Hecw2Q6I6G8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Hecw2Q6I6G8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Hecw2Q6I6G8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Hecw2Q6I6G8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Hecw2Q6I6G8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Hecw2Q6I6G8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Hecw2Q6I6G8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Hecw2Q6I6G8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Hecw2Q6I6G8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Hecw2Q6I6G8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Hecw2Q6I6G8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Hecw2Q6I6G8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Hecw2Q6I6G8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Hecw2Q6I6G8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Hecw2Q6I6G8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Hecw2Q6I6G8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Hecw2Q6I6G8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Hecw2Q6I6G8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Hecw2Q6I6G8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Hecw2Q6I6G8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Hecw2Q6I6G8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Hecw2Q6I6G8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Hecw2Q6I6G8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Hecw2Q6I6G8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Hecw2Q6I6G8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Hecw2Q6I6G8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Hecw2Q6I6G8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Hecw2Q6I6G8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Hecw2Q6I6G8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Hecw2Q6I6G8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Hecw2Q6I6G8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Hecw2Q6I6G8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Hecw2Q6I6G8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Hecw2Q6I6G8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Hecw2Q6I6G8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Hecw2Q6I6G8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Hecw2Q6I6G8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Hecw2Q6I6G8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Hecw2Q6I6G8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Hecw2Q6I6G8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms