Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Knl1Q66JQ7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Knl1Q66JQ7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Knl1Q66JQ7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Knl1Q66JQ7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Knl1Q66JQ7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
Knl1Q66JQ7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Knl1Q66JQ7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Knl1Q66JQ7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Knl1Q66JQ7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Knl1Q66JQ7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Knl1Q66JQ7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Knl1Q66JQ7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Knl1Q66JQ7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Knl1Q66JQ7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Knl1Q66JQ7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Knl1Q66JQ7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Knl1Q66JQ7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Knl1Q66JQ7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Knl1Q66JQ7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Knl1Q66JQ7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Knl1Q66JQ7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Knl1Q66JQ7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Knl1Q66JQ7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Knl1Q66JQ7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Knl1Q66JQ7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Knl1Q66JQ7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Knl1Q66JQ7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Knl1Q66JQ7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Knl1Q66JQ7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Knl1Q66JQ7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Knl1Q66JQ7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Knl1Q66JQ7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Knl1Q66JQ7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Knl1Q66JQ7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Knl1Q66JQ7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Knl1Q66JQ7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Knl1Q66JQ7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Knl1Q66JQ7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Knl1Q66JQ7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Knl1Q66JQ7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Knl1Q66JQ7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Knl1Q66JQ7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Knl1Q66JQ7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Knl1Q66JQ7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Knl1Q66JQ7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Knl1Q66JQ7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Knl1Q66JQ7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Knl1Q66JQ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Knl1Q66JQ7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Knl1Q66JQ7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Knl1Q66JQ7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Knl1Q66JQ7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Knl1Q66JQ7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Knl1Q66JQ7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Knl1Q66JQ7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Knl1Q66JQ7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Knl1Q66JQ7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Knl1Q66JQ7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Knl1Q66JQ7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Knl1Q66JQ7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Knl1Q66JQ7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Knl1Q66JQ7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Knl1Q66JQ7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Knl1Q66JQ7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Knl1Q66JQ7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Knl1Q66JQ7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Knl1Q66JQ7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Knl1Q66JQ7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Knl1Q66JQ7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Knl1Q66JQ7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Knl1Q66JQ7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Knl1Q66JQ7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Knl1Q66JQ7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Knl1Q66JQ7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Knl1Q66JQ7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Knl1Q66JQ7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Knl1Q66JQ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Knl1Q66JQ7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Knl1Q66JQ7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Knl1Q66JQ7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Knl1Q66JQ7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Knl1Q66JQ7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Knl1Q66JQ7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Knl1Q66JQ7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Knl1Q66JQ7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Knl1Q66JQ7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Knl1Q66JQ7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Knl1Q66JQ7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Knl1Q66JQ7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Knl1Q66JQ7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Knl1Q66JQ7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Knl1Q66JQ7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Knl1Q66JQ7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Knl1Q66JQ7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Knl1Q66JQ7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Knl1Q66JQ7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Knl1Q66JQ7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Knl1Q66JQ7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Knl1Q66JQ7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms