Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcg1Q64343 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcg1Q64343 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcg1Q64343 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcg1Q64343 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcg1Q64343 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcg1Q64343 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcg1Q64343 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcg1Q64343 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcg1Q64343 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcg1Q64343 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcg1Q64343 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcg1Q64343 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcg1Q64343 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcg1Q64343 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcg1Q64343 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcg1Q64343 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcg1Q64343 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcg1Q64343 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcg1Q64343 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcg1Q64343 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcg1Q64343 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Abcg1Q64343 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcg1Q64343 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcg1Q64343 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcg1Q64343 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcg1Q64343 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcg1Q64343 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcg1Q64343 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcg1Q64343 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcg1Q64343 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcg1Q64343 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcg1Q64343 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcg1Q64343 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcg1Q64343 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcg1Q64343 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcg1Q64343 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcg1Q64343 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcg1Q64343 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcg1Q64343 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcg1Q64343 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcg1Q64343 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcg1Q64343 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcg1Q64343 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcg1Q64343 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcg1Q64343 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcg1Q64343 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcg1Q64343 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcg1Q64343 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcg1Q64343 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcg1Q64343 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcg1Q64343 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcg1Q64343 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcg1Q64343 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcg1Q64343 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcg1Q64343 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcg1Q64343 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms