Protein–RNA interactions for Protein: Q64302

Tm4sf1, Transmembrane 4 L6 family member 1, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf1Q64302 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tm4sf1Q64302 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tm4sf1Q64302 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Tm4sf1Q64302 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tm4sf1Q64302 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tm4sf1Q64302 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tm4sf1Q64302 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tm4sf1Q64302 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tm4sf1Q64302 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tm4sf1Q64302 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Tm4sf1Q64302 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tm4sf1Q64302 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tm4sf1Q64302 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tm4sf1Q64302 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tm4sf1Q64302 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tm4sf1Q64302 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tm4sf1Q64302 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tm4sf1Q64302 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tm4sf1Q64302 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tm4sf1Q64302 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tm4sf1Q64302 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tm4sf1Q64302 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Tm4sf1Q64302 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tm4sf1Q64302 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tm4sf1Q64302 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tm4sf1Q64302 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tm4sf1Q64302 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tm4sf1Q64302 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tm4sf1Q64302 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tm4sf1Q64302 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tm4sf1Q64302 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tm4sf1Q64302 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tm4sf1Q64302 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tm4sf1Q64302 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Tm4sf1Q64302 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Tm4sf1Q64302 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tm4sf1Q64302 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Tm4sf1Q64302 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tm4sf1Q64302 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tm4sf1Q64302 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tm4sf1Q64302 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tm4sf1Q64302 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tm4sf1Q64302 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Tm4sf1Q64302 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tm4sf1Q64302 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tm4sf1Q64302 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Tm4sf1Q64302 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Tm4sf1Q64302 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tm4sf1Q64302 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tm4sf1Q64302 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tm4sf1Q64302 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tm4sf1Q64302 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tm4sf1Q64302 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tm4sf1Q64302 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Tm4sf1Q64302 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tm4sf1Q64302 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tm4sf1Q64302 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Tm4sf1Q64302 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Tm4sf1Q64302 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tm4sf1Q64302 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tm4sf1Q64302 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tm4sf1Q64302 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tm4sf1Q64302 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tm4sf1Q64302 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Tm4sf1Q64302 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tm4sf1Q64302 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tm4sf1Q64302 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Tm4sf1Q64302 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tm4sf1Q64302 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tm4sf1Q64302 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tm4sf1Q64302 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tm4sf1Q64302 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tm4sf1Q64302 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tm4sf1Q64302 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tm4sf1Q64302 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tm4sf1Q64302 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tm4sf1Q64302 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tm4sf1Q64302 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tm4sf1Q64302 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Tm4sf1Q64302 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tm4sf1Q64302 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tm4sf1Q64302 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tm4sf1Q64302 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tm4sf1Q64302 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Tm4sf1Q64302 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Tm4sf1Q64302 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tm4sf1Q64302 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Tm4sf1Q64302 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Tm4sf1Q64302 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tm4sf1Q64302 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tm4sf1Q64302 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tm4sf1Q64302 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tm4sf1Q64302 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tm4sf1Q64302 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tm4sf1Q64302 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tm4sf1Q64302 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tm4sf1Q64302 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Tm4sf1Q64302 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tm4sf1Q64302 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tm4sf1Q64302 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms