Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nr2e1Q64104 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nr2e1Q64104 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nr2e1Q64104 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nr2e1Q64104 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nr2e1Q64104 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nr2e1Q64104 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nr2e1Q64104 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nr2e1Q64104 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nr2e1Q64104 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nr2e1Q64104 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nr2e1Q64104 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nr2e1Q64104 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nr2e1Q64104 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nr2e1Q64104 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nr2e1Q64104 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nr2e1Q64104 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nr2e1Q64104 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nr2e1Q64104 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nr2e1Q64104 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nr2e1Q64104 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nr2e1Q64104 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nr2e1Q64104 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr2e1Q64104 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr2e1Q64104 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr2e1Q64104 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nr2e1Q64104 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nr2e1Q64104 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nr2e1Q64104 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr2e1Q64104 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr2e1Q64104 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr2e1Q64104 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr2e1Q64104 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nr2e1Q64104 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr2e1Q64104 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr2e1Q64104 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr2e1Q64104 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr2e1Q64104 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nr2e1Q64104 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nr2e1Q64104 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nr2e1Q64104 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nr2e1Q64104 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nr2e1Q64104 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr2e1Q64104 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr2e1Q64104 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr2e1Q64104 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nr2e1Q64104 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nr2e1Q64104 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nr2e1Q64104 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nr2e1Q64104 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nr2e1Q64104 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nr2e1Q64104 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nr2e1Q64104 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nr2e1Q64104 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nr2e1Q64104 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nr2e1Q64104 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nr2e1Q64104 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nr2e1Q64104 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nr2e1Q64104 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nr2e1Q64104 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Nr2e1Q64104 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nr2e1Q64104 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nr2e1Q64104 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nr2e1Q64104 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nr2e1Q64104 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr2e1Q64104 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr2e1Q64104 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr2e1Q64104 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr2e1Q64104 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr2e1Q64104 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr2e1Q64104 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr2e1Q64104 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nr2e1Q64104 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nr2e1Q64104 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr2e1Q64104 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms