Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phc1Q64028 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phc1Q64028 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phc1Q64028 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Phc1Q64028 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Phc1Q64028 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phc1Q64028 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phc1Q64028 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phc1Q64028 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phc1Q64028 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phc1Q64028 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phc1Q64028 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phc1Q64028 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Phc1Q64028 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phc1Q64028 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phc1Q64028 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phc1Q64028 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phc1Q64028 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phc1Q64028 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phc1Q64028 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phc1Q64028 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phc1Q64028 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phc1Q64028 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phc1Q64028 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phc1Q64028 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phc1Q64028 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phc1Q64028 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phc1Q64028 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phc1Q64028 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phc1Q64028 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phc1Q64028 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phc1Q64028 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phc1Q64028 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phc1Q64028 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phc1Q64028 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Phc1Q64028 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phc1Q64028 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phc1Q64028 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phc1Q64028 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phc1Q64028 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phc1Q64028 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phc1Q64028 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Phc1Q64028 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Phc1Q64028 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Phc1Q64028 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Phc1Q64028 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Phc1Q64028 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phc1Q64028 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phc1Q64028 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phc1Q64028 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phc1Q64028 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phc1Q64028 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phc1Q64028 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phc1Q64028 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phc1Q64028 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phc1Q64028 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phc1Q64028 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phc1Q64028 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phc1Q64028 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Phc1Q64028 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Phc1Q64028 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phc1Q64028 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phc1Q64028 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phc1Q64028 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phc1Q64028 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Phc1Q64028 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phc1Q64028 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phc1Q64028 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phc1Q64028 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phc1Q64028 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phc1Q64028 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phc1Q64028 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phc1Q64028 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phc1Q64028 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phc1Q64028 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phc1Q64028 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phc1Q64028 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms