Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou4f3Q63955 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou4f3Q63955 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou4f3Q63955 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou4f3Q63955 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou4f3Q63955 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou4f3Q63955 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou4f3Q63955 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou4f3Q63955 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou4f3Q63955 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou4f3Q63955 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou4f3Q63955 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pou4f3Q63955 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou4f3Q63955 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou4f3Q63955 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou4f3Q63955 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou4f3Q63955 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pou4f3Q63955 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pou4f3Q63955 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou4f3Q63955 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou4f3Q63955 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou4f3Q63955 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou4f3Q63955 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou4f3Q63955 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou4f3Q63955 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou4f3Q63955 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou4f3Q63955 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou4f3Q63955 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou4f3Q63955 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou4f3Q63955 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou4f3Q63955 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou4f3Q63955 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou4f3Q63955 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou4f3Q63955 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou4f3Q63955 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou4f3Q63955 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou4f3Q63955 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou4f3Q63955 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou4f3Q63955 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou4f3Q63955 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou4f3Q63955 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou4f3Q63955 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou4f3Q63955 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou4f3Q63955 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou4f3Q63955 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou4f3Q63955 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou4f3Q63955 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou4f3Q63955 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou4f3Q63955 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou4f3Q63955 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou4f3Q63955 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou4f3Q63955 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou4f3Q63955 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou4f3Q63955 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou4f3Q63955 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou4f3Q63955 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Pou4f3Q63955 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pou4f3Q63955 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pou4f3Q63955 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pou4f3Q63955 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pou4f3Q63955 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pou4f3Q63955 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pou4f3Q63955 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pou4f3Q63955 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pou4f3Q63955 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pou4f3Q63955 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pou4f3Q63955 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pou4f3Q63955 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pou4f3Q63955 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pou4f3Q63955 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pou4f3Q63955 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pou4f3Q63955 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Pou4f3Q63955 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pou4f3Q63955 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pou4f3Q63955 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pou4f3Q63955 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pou4f3Q63955 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms